International Conference on Information and Knowledge Technology

Home / دوازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

شناسایی کمپلکس‎ های پروتئینی با استفاده از داده‎ های زیستی و خوشه بندی فازی

Authors :

مریم مولی وردیخانی¹ سعید جلیلی²

1- دانشگاه تربیت مدرس 2- دانشگاه تربیت مدرس

Keywords :

داده بیان ژن، داده TAP، شبکه برهمکنش پروتئین، کمپلکس پروتئینی، گراف هستان شناسی ژن

Abstract :

شناسایی کمپلکس‏ های پروتئینی از روی شبکه‎ های برهمکنش پروتئینی یکی از وظایف بنیادی در بیوانفورماتیک است. روش‎ های آزمایشگاهی داده‎ های با ارزشی برای استنتاج کمپلکس ‎های پروتئینی فراهم کرده ‎اند. با این وجود، این روش ‎ها محدویت‎ های ذاتی دارند. با توجه به این محدودیت‎ ها، در دهه گذشته روش‌ های محاسباتی بسیاری برای شناسایی کمپلکس ‎های پروتئینی، ارائه شده ‎اند. در بسیاری از روش‌ های ارائه شده ماهیت پویا و همپوشانی کمپلکس ‎های پروتئینی نادیده گرفته می شود. در این طرح، روشی با استفاده از شبکه برهمکنش پروتئین، داده‎ های بیان ژن، گراف هستان‎ شناسی ژن، داده TAP و الگوریتم خوشه‎ بندی فازی C-means برای شناسایی کمپلکس‎ های پروتئینی ارائه شده است. نتایج آزمایش ‎ها نشان می دهد این روش نسبت به سایر روش‌ های به روز شناسایی کمپلکس ‎های پروتئینی عملکرد بهتری دارد.