کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

English

صفحه اصلی / یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs

نویسندگان :

Zahra Razaghi Moghadam Kashani¹ Ali Masoudi-nejad² Abbas Nowzari-dalini³

1- موسسه ماکس پلانک 2- دانشگاه تهران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms

چکیده :

Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

Using Deconvolutional Variational Autoencoder for Answer Selection in Community Question Answering

Golshan Afzali Boroujeni - Heshaam Faili

قطعه بندی خودکار توده کلیه در تصاویر توموگرافی کامپیوتری با استفاده از هم‌افزایی شبکه عصبی عمیق U-Net و الگوریتم فراابتکاری نهنگ

علی خلیلی - محمد مصلح - محمد خیراندیش

بررسی امنیت وفقی در اینترنت وسایل نقلیه

سیده یگانه غیور باغبانی - دکتر سعید جلیلی سیده یگانه غیور باغبانی - سعید جلیلی -

Heart Sound Classification based on Group-based Sparse Features of PCG Signal

Zahra Hossein-Nejad - Mehdi Nasri

Face Recognition Based on Local Statistical Features and Artificial Neural Network

Mehdi Moghimi - Dr Hadi Grailu

‌نقشه های شناختی فازی پیشرفته (FCM) رویکردی برای مدل سازی سیستم های پیچیده ی پویا

فریبا اسلامی امیرآبادی - کمال میرزایی بدرآبادی

Persian Language Understanding in Task-oriented Dialogue System for Online Shopping

Zeinab Borhanifard - Hossein Basafa - Seyedeh Zahra Razavi - Heshaam Faili

Improving Privacy Protection in a Collaborative Blockchain-based E-Health Records System

Arman Emam-Hoseini - Samane Sobuti - دکتر سیاوش خرسندی - Alireza Hashemi-Golpayeghani

A Novel Approach to Data mining algorithms and IoT based data mining machine learning

Danial Ramezani - Seyed Hossein Siadat

Video Steganography in HEVC Using Intra-Prediction Modes

Vahidreza Seirafian - Masoud Omomi

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 41.3.1