0% Complete
English
صفحه اصلی
/
یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش
ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs
نویسندگان :
Zahra Razaghi Moghadam Kashani
1
Ali Masoudi-nejad
2
Abbas Nowzari-dalini
3
1- موسسه ماکس پلانک
2- دانشگاه تهران
3- دانشگاه تهران
کلمات کلیدی :
Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms
چکیده :
Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
Enhancing Software Effort Estimation with an Integrated Approach of Particle Swarm Optimization and Genetic Algorithms in Analogy-based Method
Ehsan Nasr - Keyvan Mohebbi
توسعه مدل مفهومی طراحی فرآیند مدیریت بحران سیلاب از طریق بهینه سازی استفاده از دستگاه های اینترنت اشیاء (IoT Devices) در تصمیم گیری
محمود رسولی - سید احسان ملیحی
A Topic Based Method to Classify the Question Clarity in CQA Networks
Alireza Khabbazan - Dr Ahmad Ali Abin
یک سیستم پاسخ به نفوذ در شبکه های اینترنت اشیاء با استفاده از شبکه های مبتنی بر نرم افزار
احسان شاهرخی مینا - رضا محمدی - محمد نصیری
طراحی و کنترل تطبیقی اورتز رباتیک پایین تنه با استفاده کنترلر منطقی قابل برنامه ریزی و رابط انسان با ماشین
فرهاد عظیمی فر - ستایش کرمی - نیایش امینی
An OWA-Powered Dynamic Customer Churn Modeling in the banking industry Based on Customer Behavioral Vectors
Masoud Alizadeh - Mohammad Soleymannejad - Behzad Moshiri
بکارگیری الگوریتم بهینه سازی فاخته و منطق فازی به منظور بهبود زمانبندی وظایف در محیط محاسبات مه
فاطمه دوامی - حمید جلیلوند - فاطمه نجفی
Enhancing Persian Speech Emotion Recognition with Contrastive Learning and Multimodal Fusion
Mobina Esmaeili - Vajiheh Sabeti
هوشمندسازی پایش کیفیت رنگزنی داخلی گرین تایر و تحلیل داده برای بهینه سازی عمر بلادر، مصرف رنگ و ریشه یابی عیوب پخت
سامان ثنایی - رضا رحیمی
A Blockchain Architecture for Secure, High-Speed P2P Energy Trades with Game-Theoretic Coalition Formation
Amin Aboutalebi Najafabadi - Seyed Hossein Hosseinian
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 43.8.0
